体育部成立于2001年10月，现设办公室、传统保健体育教研室、基础体育教研室、运动与健康教研室、群体活动及竞赛中心、体质测试中心，负责全校公共体育课教学、群体竞赛、学生体质测试等各项体育工作。体育部现有教职工23人，其中专任教师18人，教授2人、副教授6人、中级职称8人、初级职称2人。

以武术段位制进行体教融合的新尝试，推行“1+1+X”的体育课教育教学模式。目前，3门体育课程获校级课程思政示范课程立项，1个教学团队获校级示范教学团队立项。

将“体医融合”理念引入传统保健体育教育教学，获国家社科基金1项， 福建省第十一届高等教育教学成果奖一等奖1项。近三年以来，获得国家级、省级团体或个人奖项260项，其中国家级赛事168项、省级赛事92项。